Cronograma para o fluxo de trabalho analítico completo fornecido pela Htganalyzer. Crédito: Laia Díez-Ahijado / Ice Global
O Instituto Barcelona de Saúde Global (ICE Global) lançou a Htganalyzer, uma nova ferramenta de bioinformática bioinformática fácil, fácil de usar, rápida e reproduzida para análise de dados transcriptômicos avançados. Este pacote foi projetado no ambiente estatístico e simplifica processos analíticos complexos, disponibilizando -os para profissionais sem experiência específica em bioinformática.
A análise transcriptômica examina todas as moléculas de rNA mensageiro encontradas em uma célula em um determinado momento, que revela quais genes são expressos e em que quantidade. Esta informação é crucial na medicina de precisão, um método destinado a adaptar tratamentos para o perfil genético e molecular de cada paciente.
Apesar de seu potencial clínico, a implementação de técnicas transcriptômicas não foi limitada pela produção de dados, mas pela complexidade da análise bioinformática necessária.
Uma ferramenta amigável para clínicas e pesquisadores
Para enfrentar esse desafio, a equipe global do ICE desenvolveu Htganalyzer: uma ferramenta automatizada, gratuita e fácil de usar para clínicas com diferentes especialidades. Laia Díez-Ahijo foi a principal autora da ferramenta, que foi conceituada em conjunto por Natalia Rakislova e Robert Albero.
O estudo, publicado em computadores em biologia e medicina, mostra como o htganalyzer simplifica fluxos de trabalho transcriptômicos complexos, incluindo importações de dados e normalização, controle de qualidade de teste, análise de expressão gênica diferencial, enriquecimento funcional, perfil de micro ambiente e análise de sobrevivência. A ferramenta usa os dados moleculares dos pacientes para identificar diferenças biológicas e clínicas e, assim, apoiar a interpretação clínica dos resultados.
Validação usando dados reais de oncologia
O Htganalyzer foi validado usando vários métodos de dados, incluindo dados de RNA-seq do câncer através do Atlas (TCGA) e uma coorte de pacientes com câncer vulvar-malignidade rara e às vezes agressiva.
Neste último caso, a ferramenta identificou genes diferencialmente expressos, descreveu seus perfis imunológicos e revelou genes e caminhos celulares ligados a esse câncer e à sobrevida do paciente. Esses achados destacam o potencial clínico do htganalyzer de gerar conhecimento que se aplica ao diagnóstico, tratamento e prognóstico do câncer.
Com esse desenvolvimento, a equipe de pesquisa alcançou seu objetivo de preencher a lacuna entre análises bioinformáticas complexas e as necessidades práticas dos ambientes clínicos e de pesquisa. O Htganalyzer permite que profissionais sem competência avançada de bioinformática para realizar análises transcriptômicas importantes que são cada vez mais usadas na medicina pessoal para informar o diagnóstico, prognóstico e tratamentos pessoais com base na biologia molecular do paciente.
Mais informações:
Laia Díez-Ahiju et al., Htganalyzer: uma package R disponível com uma interface da Web para uma análise transcriptômica aprimorada em medicina de precisão, computadores em biologia e medicina (2025). Doi: 10.1016/j.compbiomed.2025.110772
Fornecido pelo Instituto de Saúde Global de Barcelona
Citar: Ferramenta de ferramenta amigável Formulários Formulários transcriptômicos Análise de dados para aplicações de medicina de precisão (2025, 8 de agosto) 9 de agosto de 2025 de https://medicalxpress.com/news/2025-08-user-Vearly-Tooltranscriptomic-Análise.html
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